@Luan, pelo que entendi da sua ER, sua consulta terá que relacionar o id_usuario da tb usuário com id_usuario da tabela paciente, para pegar o id_setor, dai vc relaciona com o id_setor da tabela setor e pega o id_unidade, para finalmente chegar na tabela do usuário.
Não sei como o Yii faz esse tratamento com os relations que ele cria, mas acredito que consiga fazer algo como $model->Nome_do_relaciomento->nome_do_segundo_relaciomaneto->nome_do_terceiro_relacionamento (desculpe escrever assim meio vago é q não tenho nenhuma app Yii aqui para sugerir os nomes + próximos)
Caso não consiga dessa forma o Yii permite que crie suas queries personalizadas daí vc monta seus joins como descrevi no primeiro paragrafo. Acho que esse é o caminho.